盐城工学院原综合档案室成立于1985年，2008年成立盐城工学院档案馆。盐城工学院档案馆是学校综合性档案保管、利用中心和档案业务指导监督机构，现管理盐城工业专科学校、盐城职业大学、盐城会计学校、盐城工学院四个全宗，包括党群、行政、教学、科研、产品、设备、外事、出版、基建、财会、声像、实物等 12 个类别.

学校领导高度重视档案工作，为档案馆（室）的发展提供了充分的物质保证，加大对档案馆（室）的投入，库房面积和办公条件得到了较大改善。为加快档案管理现代化的步伐，学校设档案信息数字化等专项经费，为档案馆（室）建立了局域网，添置服务器和网络版本的档案管理软件。

2003 年以来，档案馆（室）代表学校和院长办公室加强了档案业务规范的建设，先后颁发了《盐城工学院档案实体分类编号办法》、《盐城工学院文件材料部门归档范围、保管期限、分类表》、《盐城工学院 < 归档文件整理归则 > 实施细则 ( 试行 ) 》、《盐城工学院综合档案工作年度检查评比奖惩办法》、《盐城工学院综合档案室档案借阅办法》等文件，并组织各部门分管领导和专兼职档案员认真学习与贯彻落实。档案馆（室）在江苏省高校档案界较早完成了归档文件的整理改革，从 2003 年起对所有应该归档文件材料的整理，实现由“卷”到“件”、由卷皮到档案盒的根本转变。

档案馆（室）在做好档案管理工作的同时，注重以档案学术研究进一步推动档案工作的开展。学校每年均参加国家、省、市档案学术研讨会，近几年来共计发表论文30多 篇，其中在核心期刊发表 15 篇，被人大复印资料全文转录 3 篇，多次获得中国高教学会档案分会、省高校档案研究会、省档案局优秀论文二、三等奖。

2006年6月，盐城工学院档案馆（室）经省档案局、省教育厅、盐城市档案局专家组评审，全省高校系统第一家、盐城市区第一家通过档案工作特一级（五星级）评定。盐城工学院档案馆（室）连续10多年荣获全市档案工作先进集体，2007年被评为全省档案工作优秀集体，荣获全省优秀档案成果编研三等奖。